В Отечественной войне участвует с 13 Марта 1943 года по Май 1944 года на Воронежском, Степном, 2-м Украинском фронтах в составе 240-го ИАП и с Августа 1944 года на 3-м Прибалтийском, 1-м Белорусском фронтах в составе 176-го ГвИАП КОАНП.

За весь период боевых действий произвёл 326 боевых вылетов, из них: на разведку войск противника - 14, на сопровождение штурмовиков и бомбардировщиков - 116, на прикрытие своих войск в районе поля боя - 109, на перехват самолётов противника - 8, на свободную охоту - 79.

В процессе выполнения боевых заданий на свободную охоту произвёл 16 штурмовок по железнодорожным эшелонам и скоплениям живой силы противника. Провёл 117 воздушных боёв, в ходе которых сбил лично 60 самолётов противника: 17 Ю-87, 2 Хе-111, 3 Хш-129, 18 Ме-109, 19 ФВ-190 и 1 ПЗЛ-24. Сам сбит не был. Материалы, подтверждающие факты сбития самолётов противника хранятся в штабе полка.

22.07.1943 г. за 3 лично сбитых самолёта противника и 28 успешных боевых вылетов награждён орденом "Красное Знамя".

30.09.1943 г. за 3 лично сбитых самолёта противника и 48 успешных боевых вылетов награждён орденом "Красное Знамя".

04.02.1944 г. за 20 лично сбитых самолётов противника удостоен звания "Герой Советского Союза".

19.08.1944 г. за 34 лично сбитых самолётов противника удостоен звания "Дважды Герой Советского Союза".

07.02.1944 г. за лично 8 сбитых самолётов противника представлен к ордену Суворова 3-й степени - награды не получил.

15.02.1945 г. за лично 8 сбитых самолётов противника представлен к ордену "Красное Знамя".

Выполняя боевые задания на сопровождение бомбардировщиков и штурмовиков, показал себя умеющим отлично организовывать их прикрытие над целью. Несмотря на неоднократные стремительные атаки больших групп истребителей противника, штурмовики и бомбардировщики имели возможность беспрепятственно выполнять боевые задачи, не имея своих потерь.

В воздушных боях тов. Кожедуб проявил себя смелым, решительным, бесстрашным и мужественном, не знающим страха в боях за Социалистическую Родину, героически сражающимся с количественно превосходящими силами противника, проявляющим исключительное умение и находчивость в поиске врага, вследствие чего большинство вылетов на свободную охоту заканчивается встречей и боями. Яркими примерами бесстрашия умения побеждать врага являются следующие характерные воздушные бои:

9.07.1943 г. в составе 4 Ла-5 атаковал 15 самолётов противника - 9 Ю-87, 4 Ме-109 и 2 ФВ-190, из которых один самолёт противника Ме-109, сбил при первой атаке. В другом воздушном бою против 7 самолётов противника 5 Ме-109 и 2 ФВ-190 сбил ещё один Ме-109.

14.08.1943 г. под командой Кожедуб 6 Ла-5 сопровождали разведчик Пе-2. 10 истребителей противника Me-109 завязали воздушный бой. Из воздушного боя вышла победителем группа Кожедуба, где он лично сбил 2 самолёта Me-109, не имея своих потерь.

16.08.1943 г. прикрывая наземные войска в районе Рогань в составе 10 Ла-5, встретили группу бомбардировщиков: 10 Ю-87, 30 Хе-111 под прикрытием до 20 Me-109. Стремительными атаками строй бомбардировщиков был нарушен, некоторые сбросили в беспорядке бомбы вне цели. Кожедуб атаковал и сбил одного Ю-87 и в паре с ведомым зажёг одного Хе-111.

1.10.1943 г. в районе западнее Погребная 6 Ла-5, ведущий Кожедуб, атаковали 2 группы бомбардировщиков Ю-87 до 40 самолётов. Смелыми атаками нарушили строй и противник в беспорядке сбросил бомбы вне цели. В этом бою руководимая им группа сбила 4 Ю-87. Лично Кожедуб сбил 2 Ю-87.

2.10.1943 г. 9 Ла-5, под командой Кожедуба вели воздушный бой с группой до 27 бомбардировщиков под прикрытием 6 Me-109. Первую атаку произвели по ближней группе немецких бомбардировщиков, в результате противник сбросил бомбы в беспорядке. Подходящую вторую группу активными атаками превратили в бегство. Подходящая третья группа, заметив истребителей, не дойдя до цели, сбросила бомбы на головы своих войск. В этом бою Кожедуб лично сбил 2 самолёта противника, 1 Ю-87 и 1 Me-109, а руководимая им группа сбила 7 самолётов противника, не имея своих потерь.

4.10.1943 г. группа 14 Ла-5 под командой Кожедуб атаковала 60 самолётов противника Ю-87 под прикрытием 12 истребителей Me-109. Первой атакой боевой порядок бомбардировщиков был расстроен. Командуя шестёркой Ла-5, произвёл атаку по 20 Ю-87, не допустил их к цели, преследуя их, заставил сбросить бомбовую нагрузку на свои войска. В проведённом бою лично сбил 1 самолёт противника Me-109.

29.04.1944 г. 6 Ла-5 под командой Кожедуба прикрывали наземные войска в районе севернее Яссы, где встретили 10 Хш-129, сопровождаемых 4 Me-109. Атакуя самолёты противника, Кожедуб сбил 2 Хш-129 и не допустил их к цели.

3.06.1944 г. прикрывая войска севернее Яссы, 8 Ла-5, ведущий Кожедуб, встретили 8 ФВ-190, которые бой не приняли и ушли на юг. Пришедшие вслед за ними 30 Ю-87 под прикрытием 4 Me-109 и на бреющем полёте до 8 Хш-129 были атакованы нашими истребителями. Кожедуб атаковал Ю-87 и был связан боем парой ФВ-190. Развернувшись левым боевым разворотом, зашёл одному ФВ-190 в хвост и сверху под ракурсом 1/4, с дистанции 100 метров сбил его. Самолёт упал в районе Горшечий.

Выйдя из атаки правым боевым разворотом, был атакован ФВ-190. Довернувшись вправо, Кожедуб зашёл ему в хвост и, когда противник потерял скорость, сзади под ракурсом 1/4 открыл огонь и сбил. В этом бою группа сбила 3 самолёта противника.

22.09.1944 г. Кожедуб в паре с лейтенантом Шараповым вылетел на прикрытие переправ на участке Рамныэки, Даксты. В районе 10 - 15 км северо - западнее переправ на высоте 2000 - 3000 метров встретили и вели воздушный бой с 14 ФВ-190 группами по 4 - 8 самолётов. Кожедуб зайдя в хвост левому ведомому из группы ФВ-190 с бомбами с дистанции 150 метров сзади - сверху атаковал и сбил. Самолёт противника перевернулся на спину и отвесным пикированием врезался в землю в районе 10 - 15 км северо - западнее Стрельчи. Остальные самолёты этой группы сбросили беспорядочно бомбы и с переворота пикированием ушли на запад. Продолжая выполнять задание на высоте 1500 метров обнаружили группу до 6 ФВ-190 на встречных курсах, зайдя с полупереворота в хвост ведущему сверху - слева с дистанции 150 - 50 метров Кожедуб атаковал и сбил его, самолёт упал в районе 8 - 10 км юго - западнее переправ. Во время выхода из атаки ведомый был подбит ЗА. В дальнейшем бой вёл с 4 ФВ-190 Кожедуб один. Произвёл несколько атак по самолёту противника, в результате чего подбил самолёт ведущего. При ведении воздушного боя экипажи были обстреляны сильным огнём ЗА.

10.02.1945 г. возвратившись с задания над аэродромом встретил одного ФВ-190, Кожедуб атаковал сзади слева и с дистанции 70 метров сбил его. Самолёт противника загорелся и упал на окраине аэродрома. Лётчик, выбросившийся с парашютом был взят в плен.

12.02.1945 г. пара майора Кожедуба вылетев на прикрытие переправ через р. Одер, западнее переправы у Кинитц на высоте 400 - 500 метров под облачностью встретили группу до 18 ФВ-190 с бомбами. Кожедуб атаковал сзади - снизу и сбил 1 ФВ-190, самолёт противника врезался в землю в районе боя, на глазах наземных войск. При последующих атаках сбил ещё 2 ФВ-190, которые упали в том же районе.

Вторую атаку произвёл по другому ФВ-190 под ракурсом 3/4 и с дистанции 100 метров зажёг его, самолёт противника упал в том же районе. В районе 10 - 12 км. юго - западнее Кинитц, Кожедуб преследовал и атаковал третьего ФВ-190 с бомбами, который сбросил бомбы на своей территории, но был настигнут Кожедубом атакован и сбит. Самолёт противника горящим упал в 16 км юго - западнее Кинитц. При атаке Кожедубом первого "Фоккера", другой вывалился из облачности и пытался зайти ему в хвост, ведомый отсекая атаку с дистанции 50 метров сбил его, ФВ-190 загорелся и упал у пункта Лечин  ( 10 км. юго - западнее переправы Кинитц ). При второй атаке Кожедуба, ведомый обнаружил ниже одного ФВ-190 и убедившись в отсутствии опасности для ведущего сверху сзади атаковал его и сбил. Самолёт противника с пикирования врезался в землю и упал в 4 км западнее Лечин.

11.03.45 г. 4 экипажа, ведущий майор Кожедуб, вылетев на свободную охоту северо - восточнее Грайфенхаген вели воздушный бой с группой ФВ-190 и 18 Ме-109. Самолёты противника с бомбами вывалились из облачности и пытались бомбить наши войска. Кожедуб последовательно атаковал двух ФВ-190, которые сбросили бомбы на своей территории, ушли снова в облачность. Третью атаку произвёл с дистанции 70 - 50 метров и сбил ФВ-190, который упал севернее Грунха. При четвёртой атаке, Кожедуб был контратакован на встречных курсах и подбит. Ведомый Кожедуба отражая атаку пары "Фоккеров", был сам атакован двумя ФВ-190 и пошёл на высоту. Разогнав скорость заметил пару ФВ-190, атаковал ведомого с дистанции 75 метров и зажёг его. После атаки пристроившись к ведущему встретил одного ФВ-190, ведомый сделал одну атаку, место падения не наблюдал, так как был скован боем. В результате стремительных смелых атак четвёрки ведомой Кожедубом, самолёты противника пытавшиеся бомбить наши войска, вынуждены были в беспорядке сбрасывать бомбы и прикрываясь облачностью уходить на свою территорию.

18.03.1945 г. майор Кожедуб в паре вылетел на перехват истребителей противника, которые преследовали самолёты Союзников. Южнее Морин, на высоте 5000 метров, Кожедуб атаковал сзади снизу ФВ-190 и с дистанции 80 метров зажёг его, самолёт упал в 8 - 10 км севернее Кюстрин. Второго ФВ-190 атаковал и сбил на встречных курсах, самолёт противника упал в 5 - 6 км северо - западнее Кюстрин.

22.03.1945 г. пара майора Кожедуба вылетев на свободную охоту в районе Зеелов встретили до 30 ФВ-190 идущих двумя эшелонами на высоте 3000 метров и 1000 метров. Майор Кожедуб зашёл со стороны солнца сзади в хвост верхней прикрывающей группе из 4 ФВ-190, атаковал и сбил одного ФВ-190. Лётчик покинул самолёт с парашютом в районе 5 - 6 км севернее Зеелов.

Ведомый атаковал и сбил второго ФВ-190 из этой же четвёрки, после атаки вышли левым боевым разворотом и на высоте 1000 метров заметили вторую четвёрку ФВ-190. Кожедуб сзади - сверху с дистанции 180 метров атаковал и сбил второго ФВ-190, который упал в 5 - 6 км восточнее Гузов.

Являясь отличным воздушным снайпером и мастером лётного искусства, тов. Кожедуб проявил себя отличным организатором и руководителем в деле ведения групповых боёв, организации и сколачивания лётного и технического состава на выполнение поставленных задач командования.

За сбитые лично 60 самолётов противника  ( 18 Ме-109, 19 ФВ-190, 18 Ю-87, 2 Хе-111, 3 Хш-129 и 1 ПЗЛ-24 ), за проявленные в боях доблесть, мужество, отвагу и героизм достоин высшей государственной награды звания Героя Советского Союза.

Командир 176-го ГвИАП Герой Советского Союза полковник Чупиков.  31.03.1945.